Zum November 2017 ist Heike Rauer als Professorin im Fachbereich Geowissenschaften, speziell der Fachrichtung Planetologie tätig, und leitet sie das Institut für Planetenforschung des Deutschen Zentrums für Luft- und Raumfahrt (DLR). Zuvor lehrte sie an der Technischen Universität Berlin als Professorin für Planetenphysik am Zentrum für Astronomie und Astrophysik.